ИЗУЧЕНИЕ СРОДСТВА N-АЦИЛЬНЫХ ПРОИЗВОДНЫХ 2-ОКСО-1-ПИРРОЛИДИНАЦЕТАМИДА К САЙТУ СВЯЗЫВАНИЯ NMDA-РЕЦЕПТОРА МЕТОДОМ МОЛЕКУЛЯРНОГО ДОКИНГА

А. С. Чиряпкин; А. А. Глушко; И. П. Кодониди

doi:10.32415/jscientia.2019.03.01

Авторы

А. С. Чиряпкин Волгоградский государственный медицинский университет
А. А. Глушко Волгоградский государственный медицинский университет
И. П. Кодониди Волгоградский государственный медицинский университет

https://doi.org/10.32415/jscientia.2019.03.01

Ключевые слова:

2-оксо-1-пирролидинацетамид, N-ацильные производные, NMDA-рецептор, молекулярный докинг, сайт связывания, биологическая активность, прогноз

Аннотация

Поиск новых соединений, обладающих высокой ноотропной биологической активностью, является перспективным научным направлением. Современным вычислительным методом прогнозирования фармакологической активности у изучаемых соединений является молекулярный докинг. Целью работы является исследование сродства новых N-ацильных производных 2-оксо-1-пирролидинацетамида к сайту связывания NMDA-рецептора с целью поиска новых эффективных ноотропных лекарственных препаратов. В качестве объектов исследования были использованы новые N-ацильные производные 2-оксо-1-пирролидинацетамида, рацетамы, глутамат и виртуальная модель NMDA-рецептора организма Rattus norvegicus с идентификационным кодом 2A5S из базы данных RCSB PDB. Результаты проведённого вычислительного эксперимента говорят о наличии высокой ноотропной биологической активности у исследуемых соединений. Наибольшим сродством из N-ацильных производных 2-оксо-1-пирролидинацетамида к сайту связывания NMDA-рецептора обладает соединение 3. Таким образом, считаем целесообразным проведение фармакологических in vivo исследований данных соединений на предмет наличия ноотропной биологической активности.

Библиографические ссылки

Машковский М.Д. Лекарственные средства. 15-е изд. М.: Новая Волна; 2005. [Mashkovskiy MD. Lekarstvennyye sredstva. Moscow: Novaya Volna; 2005. (in Russ).]

Бурчинский С.Г. Ноотропы: классификация, механизмы действия, сравнительная характеристика фармакологических свойств. Киев: 2004. [Burchinskiy SG. Nootropy: klassifikatsiya, mekhanizmy deistviya, sravnitel'naya kharakteristika farmakologicheskikh svoistv. Kiev; 2004. (in Russ).]

Глушко А.А., Воронков А.В., Кодониди И.П., и др. Молекулярный докинг N-замещенного производного изохинолонас каталитическим доменом C // Фармация и фармакология. 2014. Т. 2. № 1(2). С. 3-7. [Gloushko AA, Voronkov AV, Kodonidi IP, et al. Molecular docking of N-substituted derivative of isoquinolone with catalyc domain of protein kinase C. Pharmacy & Pharmacology. 2014;2(1(2)):3-7. (in Russ).] doi: 10.19163/2307-9266-2014-2-1(2)-3-7.

Кодониди И.П., Чиряпкин А.С., Аненко Д.С. Компьютерное изучение спектра биологичечской активности N-ацильных производных 2-оксо-1-пирролидинацетамида // Разработка, исследование и маркетинг новой фармацевтической продукции: сборник научных трудов. Пятигорск: РИА-КМВ; 2018. Вып. 73. [Kodonidi IP, Chiriapkin AS, Anenko DS. Komp'yuternoe izuchenie spektra biologichechskoi aktivnosti N-atsil'nykh proizvodnykh 2-okso-1-pirrolidinatsetamida. In: Razrabotka, issledovanie i marketing novoi farmatsevticheskoi produktsii. Pyatigorsk: RIA-KMV; 2018. Issue 73. (in Russ).]

Чиряпкин А.С., Кодониди И.П., Аненко Д.С. Разработка методики качественного анализа N-ацильных производных 2-оксо-1-пирролидинацетамида методом тонкослойной хроматографии // Разработка, исследование и маркетинг новой фармацевтической продукции: сборник научных трудов. Пятигорск: РИА-КМВ; 2018. Вып. 73. [Chiriapkin AS, Kodonidi IP, Anenko DS. Razrabotka metodiki kachestvennogo analiza N-atsil'nykh proizvodnykh 2-okso-1-pirrolidinatsetamida metodom tonkosloinoi khromatografii. In: Razrabotka, issledovanie i marketing novoi farmatsevticheskoi produktsii. Pyatigorsk: RIA-KMV; 2018. Issue 73. (in Russ).]

Furukawa H, Singh SK, Mancusso R, et al. Subunit arrangement and function in NMDA receptors. Nature. 2005;(438):185-192. doi: 10.1038/nature04089.

Berman HM, Westbrook J, Feng Z, et al. The Protein Data Bank. Nucleic Acids Res. 2000;28(1):235-42.

Brian J Teppen. HyperChem, release 2: molecular modeling for the personal computer. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1992;32(6):757-759. doi: 10.1021/ci00010a025.

Thomsen R, Christensen MH. MolDock: a new technique for high-accuracy molecular docking. J. Med. Chem. 2006;49(11):3315-3321. doi: 10.1021/jm051197e.

Tri-ibiotech. Molegro Virtual Docker. URL: http://www.tri-ibiotech.com.